Zur Diagnose kann ein Bluttest gemacht werden, bei welchem der Diaminoxidase Wert bedtimmt wird.

Dieser Bluttest allein ist jedoch keine Bestätigung der Diagnose. Dafür ist es nötig, sich 3-4 Wochen histaminfrei zu Ernähren.

Wenn man in dieser Zeit eine verbesserung der Symptome spürt, kann man davon ausgehen, dass es eine Histaminintoleranz ist. 

Diese 3-4 Wochen nennt man Karenzphase. Dabei ernährt man sich hauptsächlich histaminfrei.

Danach folgt die Testphase. In dieser Zeit testet man jegliche Nahrungsmittel mit einem höheren Histamingehalt. 

Als letztes kommt dann die Langzeiternährung, wo man sich von mehr oder weniger verträglichen Nahrungsmittel besteht.